Karyotypering is het proces van ordening en paring van alle chromosomen die in een organisme worden gevonden om een allesomvattend beeld van de gehele chromosomenkaart van een individu te verkrijgen.
Maar laten we eerst zorgen dat we begrijpen wat chromosomen zijn in de eerste plaats. Chromosomen zijn structuren die lijken op draden die zich in de kern van elk van de cellen van uw lichaam bevinden.
Elke chromosoomstructuur bevat het volledige genetische informatieplan van je lichaam. Dit dicteert de manier waarop uw lichaam is gestructureerd, reageert op prikkels, aanleg voor ziektes, enz. Vrouwen hebben 2 'X' chromosomen en mannen hebben één 'X' en één 'Y' chromosoom. Elke cel van je lichaam bevat 23 paar chromosomen, in totaal 46 chromosomen.
Om onderzoekers in staat te stellen de sequenties van chromosomen van elke patiënt te begrijpen, gebruiken ze karyotypering-software . Dit type software is ontworpen om chromosoomanalyse uit te voeren en evalueert de structuur en het aantal chromosomen van een persoon. Door dit te doen, kunnen onderzoekers en wetenschappers afwijkingen ontdekken.
In dit artikel zullen we enkele geweldige software-opties onderzoeken waarmee je karyotyperingsanalyse kunt uitvoeren.
- 1
ArgusSoft
ArgusSoft is een geweldige softwaremogelijkheid waarmee je automatisch menselijke chromosomen kunt karyotyperen op basis van bandpositie, en kan ook worden gebruikt voor online karyotypering van dieren en chromosomen van planten.
Belangrijkste kenmerken:
- G-, Q- en R-kleuring
- Geautomatiseerde karyotypering van menselijke chromosomen met herkenning van bochten
- Geautomatiseerde karyotypering van varkenschromosomen
- 3 ingebouwde bases van standaard ideogrammen van menselijke chromosomen met verschillende helderheidsniveaus - 400, 550 en 850 niveaus
- Kan basen van standaardcromosoomideogrammen toevoegen voor andere dier- en plantensoorten
- Methodes voor monsterbereiding
- Invoer van metafaseplaatafbeeldingen met behulp van een camera en een scanner
- Een afbeelding met afbeeldingen bijvoegen
- Geautomatiseerde verdeling van toegepaste en contacterende chromosomen
- Vergelijking van chromosomen en ideogrammen
Je kunt ArgusSoft ook gebruiken om het systeem van chromosomenherkenning te trainen met behulp van vooraf ingestelde voorbereidingen, metafaseplaatafbeeldingen en karyogrammen overbrengen in de ingebouwde database, rapportpatronen produceren, karyogrammen corrigeren en ook afbeeldingen en analyseresultaten opslaan en afdrukken.
Je kunt training en ondersteuning krijgen voor het gebruik van ArgusSoft vanaf hun officiële website. Het ondersteuningscentrum omvat trainings-, onderhouds- en consultingservices.
Probeer ArgusSoft
- 2
HiBand van Applied Spectral Imaging
HiBand is een software gemaakt door Applied Spectral Imaging, die geavanceerde chromosoomanalyse kan uitvoeren met behulp van digitale karyotyperingfuncties. Deze software
maakt gebruik van geautomatiseerde scanfuncties voor een diepgaande analyse van de chromosoomstructuur.
U kunt het brede scala aan functies in HiBand gebruiken voor het indexeren, tellen, opslaan en beheren van resultaatgegevens. U kunt deze krachtige software ook gebruiken om de chromosoomsequentie automatisch te scannen.
De resultaten die zijn verkregen met behulp van de karyotyperingfuncties die zijn gevonden, kunnen HiBand worden opgeslagen op een veilige locatie met met een wachtwoord beveiligde en gecodeerde lagen. Dit geeft u gemoedsrust met betrekking tot het verliezen van belangrijke sequentiegegevens, en hierdoor verbetert u ook de efficiëntie van uw lab.
Het sorteren van de resultaten gebeurt op een zeer eenvoudige manier, je hoeft alleen maar te zoeken naar de specifieke volgorde van chromosomen en alle resultaten worden weergegeven in een goed ingesloten scherm dat gemakkelijke toegang biedt om tags aan te passen, te bekijken en ook toe te voegen van de bestanden.
Belangrijkste kenmerken:
- Brightfield Karyotyping-G-Band en R-Band
- Fluorescentie Karyotypering-Q-Band, R-band en FISH
- Spectral Karyotyping
- Automatisch chromosoom tellen
- Chromosoomindexering en classificatie
- Geavanceerde scheiding van chromosomen en geavanceerde beeldverbetering
- Afbeeldingengalerij - kan alle case metafasen en karyotypes op één scherm presenteren
- Kan chromosomen vergelijken - ze naast elkaar zien
- Abberant Ideogram - u kunt chromosomen, cellen, ideogrammen en annotaties toevoegen aan een beeldgenerator
HiBand maakt gebruik van volledig geautomatiseerde workflows voor een hogere labefficiëntie, heeft scanfuncties voor starten en weglopen, vindt metafasen, leest automatisch barcodes, uploadt afbeeldingen in realtime tijdens het scannen van dia's en exporteert ook naar Lab LIS Central Portal en Database.
Probeer HiBand
- 3
Ikaros van MetaSystems
Dit karyotyperingssysteem heeft een zeer intuïtieve gebruikersinterface die alle functies op één scherm biedt. Dit geeft gemakkelijke en snelle toegang tot alle verkregen informatie.
Ikaros kan worden gebruikt met Neon, een platform dat is ontworpen om te helpen met beeldgegevens en de organisatie van cases. Neon verzamelt gegevens van alle imagingopdrachten, externe bronnen en stelt u in staat deze op een eenvoudig te begrijpen manier te presenteren met behulp van een case management-dashboard.
Met deze tool kunt u altijd belangrijke informatie bij de hand houden en op een veilige manier opslaan, maar maakt u gebruik van zeer krachtige algoritmen voor gegevensbeheer, beschikt u over een scala aan manieren om gegevens te bekijken en kunt u specifieke zoekopdrachten uitvoeren op basis van trefwoorden en gegevenseigenschappen.
Bekijk hier meer informatie over Neon en zijn functies.
Ikaros ondersteunt veel verschillende bandtechnieken - Brightfield G-Band en R-Band, Fluorescence Q-Band, R-Band en FISH -, biedt een groot aantal vooraf gedefinieerde karyogramvormen voor mensen, planten en dieren. U kunt deze formulieren gemakkelijk bewerken om alle gegevens toe te voegen die nodig zijn voor het soort onderzoek dat u doet.
Het feit dat u chromosomen kunt vergelijken met classess of met karyogrammen, biedt u zeer nuttige informatie waarmee u eenvoudig verschillen kunt identificeren.
Probeer Ikaros
- 4
MetaClass van Microptic
MetaClass is een geweldige karyotyoping-software die modulair is ontworpen. Deze software helpt je om karyotypering en FISH-studies van chromosomen uit te voeren.
MetaClass bestaat uit de volgende modules:
- MetaClass-database
Database die kan worden geïnstalleerd met een van de modules van MetaClass. Hiermee kunt u patiëntgegevens opslaan en heeft u eenvoudig toegang tot resultaten. U kunt met deze module aangepaste rapporten in elke taal maken.
- MetaClass Karyotypering
Stelt u in staat een karyotype te bestuderen nadat de beelden van de metafasebereidingsfase digitaal zijn vastgelegd en in paren te rangschikken op basis van grootte, positie, enz. Deze module biedt u uitstekende kwaliteitsresultaten als het gaat om chromosoombanden, en het kan ook zorg voor professioneel ogende rapporten.
Belangrijkste kenmerken zijn:
- De studie van karyotype wordt geanalyseerd onder helderveld 100X vergroting
- Kan verschillende Metafase-afbeeldingen vastleggen
- De beeldkwaliteit is aanpasbaar voor betere resultaten
- Automatische classificatie van chromosomen
- 4 schermweergaven - venster Metafase, Karyotype en niet-geclassificeerde chromosomen
- Kan chromosoomprototypes weergeven
- Chromosomen die niet geclassificeerd zijn, kunnen automatisch of handmatig worden gecorrigeerd - superposities, scheiding, kruisingen, rotaties, etc.
- MTC-sessiebestanden of BMP-afbeeldingen kunnen op elk moment worden opgeslagen en opnieuw worden geladen
- Kan individuele chromosomen naar de Metaclass-database exporteren met de mogelijkheid om opmerkingen en notities toe te voegen
Hier is een voorbeeld van een Metaclass-karyotyperingrapport.
- MetaClass FISH
Dit is een analysemodule waarmee u Fluorescent IN SITU Hybridization (FISH) -afbeelding kunt verkrijgen. Deze module legt foto's vast met behulp van fluorescerende DNA-sondes en stelt u in staat genetische afwijkingen te bevestigen - trisomieën, mocrodelecties, chromosoomherschikkingen, enz.
FISH-afbeeldingen worden geanalyseerd onder een vergroting van 100X en kunnen voor een breder bereik van beeldhelderheid ook beelden met verschillende filters vastleggen.
Als u geïnteresseerd bent om meer informatie te krijgen over de hierboven beschreven modules en andere functies, kunt u een kijkje nemen in de MetaClass-catalogus.
Als u een merkwaardig type bent en een rapport wilt zien dat is verkregen met behulp van de FISH-methode, kunt u dit doen
een voorbeeld van een PDF-bestand.Probeer MetaClass
- 5
GenASis-bandweergave
GenASis Bandview is een andere geweldige karyotypering-software die is opgebouwd uit modules met verschillende capabiliteiten. U kunt deze app gebruiken om karyotyperingsdiagnostiek uit te voeren en nauwkeurige testresultaten te verkrijgen.
Met deze software kunt u de workflow en het diagnoseproces volledig aanpassen, afhankelijk van de behoeften van uw bedrijf en de doelen die u probeert te bereiken.
Het brede scala aan hulpmiddelen in BandView is eenvoudig toegankelijk met slechts één muisklik en biedt krachtige G / R / C / Q-Band-karyotypering. U kunt kiezen tussen een geautomatiseerde of een handmatige workflow als het gaat om het lokaliseren van metafasen en het vastleggen van afbeeldingen.
Chromosoomafwijkingen, indien gevonden, kunnen worden waargenomen door toevoeging, verwijdering of herrangschikking van het genetische materiaal van de patiënt. Met BandView kunt u een band met FISH-moleculaire techniek gebruiken.
FISH maakt gebruik van fluorescerende sondes om zich aan verschillende delen van het chromosoom te hechten, waardoor de software de afwijkingen in specifieke DNA-sequenties kan opsporen en lokaliseren.
Probeer GenASis Bandview
Conclusie
In dit artikel hebben we enkele van de beste geautomatiseerde karyotypering-software onderzocht die eind 2018 op de markt is.
De karyotyping-softwareopties die in dit artikel worden behandeld, bieden u een aantal functies die u zullen helpen de doelstellingen van uw bedrijf te bereiken.
Door dit soort software te gebruiken, kunt u duizenden chromosoomstructuren snel tellen, analyseren met verschillende professionele technieken en hoogwaardige rapporten produceren waarmee u eventuele afwijkingen gemakkelijk kunt identificeren.
We willen graag weten wat uw mening is over de software die we in deze top 5-lijst hebben gepresenteerd. Aarzel niet om ons dit te laten weten door het commentaar hieronder te gebruiken.
GERELATEERDE GIDSEN DIE U MOET CONTROLEEN:
- Wil je enquêtesoftware voor academisch onderzoek? Hier zijn 5 tools
- 5 beste software voor academisch schrijven
- 10 beste plagiaatsoftware om kopie-inhoud in 2019 te detecteren
